時，於總統府以視訊向在東京的世界台灣同鄉會演講：「台灣與對岸中國是一邊一國，要分清楚」。此為著名的「一邊一國論」，此論述主旨即為台灣與中國為兩個國家，而此一邊一國論承襲了李登輝總統在1999年提出的兩國論。
陳水扁總統在2002年競選總統前主張：「台灣是一個主權獨立的國家，依目前憲法稱為『中華民國』」。然而，在其就職兩年後，提出了「」一邊一國論，並在其離任的最後兩年，將郵票、國營事業名稱改為台灣，也在護照上加註Taiwan，為的就是要證明台灣就是台灣，卻又怕台灣人被中國國民黨洗腦已久，對於「中華民國」有著非常濃厚的情感，一下子將「中華民國」四個字拿掉會引起很多人的反彈，因此先採兩者並用的方式。
1912年大清國被推翻，建立了中華民國，這是建國，因為早在1644年中國這個國家就滅亡了，成為殖民地。中華民國國祚38年，迄於1949年11月20日滅亡。接續的是中華人民共和國，是在1949年10月1日建立，此稱建政，係建立新政府。
中華民國滅亡後，一些殘餘勢力逃往猶是日本殖民地的台灣，並在1950年3月1日建立中央政府，蔣介石自命總統，這在國際法、政治學及歷史學都是獨立的做法。但是蔣介石卻命名為中華民國，其主意是要「反攻大陸」、「恢復中華」，這兩個都是美化侵略中國的政治謊言）；但是台灣不是中國，於是台灣有獨立卻沒有建國，這與一般國家獨立即是建國不同。
台灣為何要使用一個在國外都抬不起頭的國號？數十年來台灣發生的大事件，國際媒體一概以Taiwan（台灣）稱呼，絕非Republic of China（「中華民國」）；然而，台灣若有重大措施發布，台灣必定以「中華民國」自稱，而國際媒體一概以Taiwan稱呼，絕無例外，如1991年結束的「動員戡亂時期」。
「中華民國」這個稱呼始於蔣介石，卻不待蔣氏下台或死亡，外國政府就稱我國為Taiwan了，這樣的Government of Taiwan（台灣政府），在幾十年後，若仍自稱Government of Republic of China（「中華民國」政府），肯定會被外國人士質疑或譏笑；這個「中華民國」只能在國內騙國人，但千萬不可拿出國外，以免被當成笑話。
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